13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3599 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1141  hypothetical protein  67.46 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.586693  normal  0.011116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3339  hypothetical protein  54.72 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0934778  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2023  hypothetical protein  32.63 
 
 		 467 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.898641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1013  hypothetical protein  30.47 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2598  hypothetical protein  35.29 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00331203  normal  0.0245461 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5296  hypothetical protein  25.37 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0857  hypothetical protein  26.03 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.610845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0094  hypothetical protein  29.06 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000060167  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0851  hypothetical protein  26.03 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0868  hypothetical protein  26.03 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5887  hypothetical protein  28.57 
 
 		 430 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1052  hypothetical protein  26.61 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>