21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5887 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5887  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  848    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0857  hypothetical protein  72.16 
 
 
497 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.610845  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0851  hypothetical protein  72.16 
 
 
429 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0868  hypothetical protein  72.16 
 
 
497 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2023  hypothetical protein  38.65 
 
 
467 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.898641  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1013  hypothetical protein  40.86 
 
 
451 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1052  hypothetical protein  42.74 
 
 
371 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2598  hypothetical protein  39.36 
 
 
440 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00331203  normal  0.0245461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0516  hypothetical protein  35.23 
 
 
250 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0152  hypothetical protein  35.23 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0298803  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10185  hypothetical protein  35.75 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0132  hypothetical protein  35.76 
 
 
249 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0151  hypothetical protein  36.36 
 
 
249 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0142  hypothetical protein  36.36 
 
 
249 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1118  hypothetical protein  34.78 
 
 
276 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0746  hypothetical protein  32.81 
 
 
273 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3599  hypothetical protein  28.4 
 
 
256 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3339  hypothetical protein  30.29 
 
 
245 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0934778  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1141  hypothetical protein  29.7 
 
 
258 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.586693  normal  0.011116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0098  hypothetical protein  29.5 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0094  hypothetical protein  28.57 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000060167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>