17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1052 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1052  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  708    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0857  hypothetical protein  43.79 
 
 		 497 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.610845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0868  hypothetical protein  43.79 
 
 		 497 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0851  hypothetical protein  43.79 
 
 		 429 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5887  hypothetical protein  41.25 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1013  hypothetical protein  38.48 
 
 		 451 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2023  hypothetical protein  37.19 
 
 		 467 aa  192  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.898641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2598  hypothetical protein  40 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00331203  normal  0.0245461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1141  hypothetical protein  29.67 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.586693  normal  0.011116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10185  hypothetical protein  30.5 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0152  hypothetical protein  31.46 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0298803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3599  hypothetical protein  27.8 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0132  hypothetical protein  32.14 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0151  hypothetical protein  30.95 
 
 		 249 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0142  hypothetical protein  30.95 
 
 		 249 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0516  hypothetical protein  30.18 
 
 		 250 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3339  hypothetical protein  27.62 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0934778  normal  0.651768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>