19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2598 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2598  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  848    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00331203  normal  0.0245461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1013  hypothetical protein  43.13 
 
 		 451 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2023  hypothetical protein  44.68 
 
 		 467 aa  246  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.898641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0857  hypothetical protein  36.31 
 
 		 497 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.610845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0851  hypothetical protein  36.31 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0868  hypothetical protein  36.31 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5887  hypothetical protein  38.78 
 
 		 430 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1052  hypothetical protein  38.89 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3599  hypothetical protein  36.8 
 
 		 256 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1141  hypothetical protein  34.41 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.586693  normal  0.011116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3339  hypothetical protein  30.8 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0934778  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0152  hypothetical protein  28.64 
 
 		 271 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0298803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10185  hypothetical protein  27.94 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0516  hypothetical protein  29.06 
 
 		 250 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0132  hypothetical protein  32.12 
 
 		 249 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0151  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0142  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1118  hypothetical protein  26.38 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0746  hypothetical protein  28.37 
 
 		 273 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>