64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2399 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2399  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
149 aa  291  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172708  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2664  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.12 
 
 
132 aa  179  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000389195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2168  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.5 
 
 
127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2707  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.7 
 
 
135 aa  155  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.08 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033179  hitchhiker  0.0000263057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12650  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  56.55 
 
 
128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.228557  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1725  hypothetical protein  58.57 
 
 
135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10557  hypothetical protein  52.41 
 
 
128 aa  131  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.309454  normal  0.0411848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0028  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.61 
 
 
127 aa  129  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0942  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168908  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0725  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.28 
 
 
123 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0731  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.28 
 
 
123 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0745  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.28 
 
 
123 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.047878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3587  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
126 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00995184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
365 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4569  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.97 
 
 
194 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64364  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5495  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.08 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00157513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1716  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.4 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.711548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1737  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.4 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.331551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1784  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.4 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1285  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.41 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  hitchhiker  0.00110448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3007  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.71 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.862449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2192  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0194216  hitchhiker  0.00758205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.28 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00159015  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2450  lactoylglutathione lyase  32 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00862071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0624  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  32 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  29.13 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2073  lactoylglutathione lyase  28.12 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  32 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  31.2 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  30.53 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2738  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.16 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6371  hypothetical protein  30.43 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2126  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.16 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0010  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.49 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8805  hypothetical protein  26.15 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  31.2 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3315  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.87 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  29.01 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  29.13 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2635  lactoylglutathione lyase  26.03 
 
 
180 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2901  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.83 
 
 
136 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000256664  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  27.34 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  25.95 
 
 
138 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.28 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.58 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.43 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5283  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.58 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  27.69 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  29.13 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  29.75 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  31.2 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4966  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  31.2 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  31.2 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  30.15 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.7 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0943124  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0854  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.576293  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4131  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.58 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.385176  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2071  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.17 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0354228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>