14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2387 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2387  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0136297  normal  0.0170325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0631  hypothetical protein  39.27 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000769552  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0839  hypothetical protein  34.97 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2920  hypothetical protein  35.48 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3265  hypothetical protein  37.3 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3125  hypothetical protein  34.24 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0028  hypothetical protein  27.6 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.29937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1957  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0559191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2787  hypothetical protein  32.8 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2233  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.294656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2699  hypothetical protein  33.97 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1912  hypothetical protein  33.77 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2228  hypothetical protein  31.07 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6222  hypothetical protein  31.16 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>