16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0839 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0839  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2787  hypothetical protein  40.83 
 
 
221 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0028  hypothetical protein  36.24 
 
 
214 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.29937  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1957  hypothetical protein  38.39 
 
 
219 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0559191  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2233  hypothetical protein  36.97 
 
 
219 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.294656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0631  hypothetical protein  38.65 
 
 
214 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000769552  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1912  hypothetical protein  36.54 
 
 
219 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3125  hypothetical protein  37.38 
 
 
214 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3265  hypothetical protein  41.26 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2387  hypothetical protein  34.01 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0136297  normal  0.0170325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2920  hypothetical protein  39.09 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2699  hypothetical protein  39.29 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2228  hypothetical protein  36.67 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6222  hypothetical protein  41.58 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308701  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0943  hypothetical protein  41.05 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.056929  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02255  hypothetical protein  25.69 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>