18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2787 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2787  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3125  hypothetical protein  59.62 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2228  hypothetical protein  58.65 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0943  hypothetical protein  54.81 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.056929  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1957  hypothetical protein  46.27 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0559191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6222  hypothetical protein  54.33 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2233  hypothetical protein  45.77 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.294656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1912  hypothetical protein  43.28 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0839  hypothetical protein  41.18 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3265  hypothetical protein  41.01 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0028  hypothetical protein  37 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.29937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0631  hypothetical protein  37.31 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000769552  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2920  hypothetical protein  40.91 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2699  hypothetical protein  33.95 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2387  hypothetical protein  32.8 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0136297  normal  0.0170325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1687  hypothetical protein  36.11 
 
 		 172 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1755  hypothetical protein  36.11 
 
 		 172 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1710  hypothetical protein  36.11 
 
 		 172 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>