15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6222 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6222  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308701  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0943  hypothetical protein  98.17 
 
 		 218 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.056929  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2228  hypothetical protein  73.85 
 
 		 216 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3125  hypothetical protein  65.57 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2787  hypothetical protein  54.33 
 
 		 221 aa  205  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1957  hypothetical protein  43.44 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0559191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1912  hypothetical protein  46.57 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2233  hypothetical protein  43.98 
 
 		 219 aa  118  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.294656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0839  hypothetical protein  42.35 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3265  hypothetical protein  44.98 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2920  hypothetical protein  42.54 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0631  hypothetical protein  39.2 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000769552  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0028  hypothetical protein  36.45 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.29937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2699  hypothetical protein  43.29 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2387  hypothetical protein  33.99 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0136297  normal  0.0170325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>