16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3125 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3125  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2228  hypothetical protein  74.06 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2787  hypothetical protein  59.62 
 
 		 221 aa  258  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0943  hypothetical protein  66.04 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.056929  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6222  hypothetical protein  65.57 
 
 		 218 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1957  hypothetical protein  45.66 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0559191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2233  hypothetical protein  47.03 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.294656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1912  hypothetical protein  45.41 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0028  hypothetical protein  36.32 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.29937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2920  hypothetical protein  39.38 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3265  hypothetical protein  41.52 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0631  hypothetical protein  35.15 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000769552  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0839  hypothetical protein  39.09 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2699  hypothetical protein  39.45 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2387  hypothetical protein  34.24 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0136297  normal  0.0170325 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0284  hypothetical protein  29.13 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>