288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1041 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1041  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000105881  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1356  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 44 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0134833  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1330  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 44 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138476  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1628  50S ribosomal protein L34  84.09 
 
 		 44 aa  72  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.499577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4361  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4498  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4517  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2334  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  65.91 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4204  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000294632  decreased coverage  0.00182284 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  69.77 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 49 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3102  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0409092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 48 aa  53.5  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 52 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3238  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3157  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0090  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 47 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3989  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3218  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3166  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2238  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2847  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565052  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  65.91 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4388  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  63.64 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 53 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 46 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 50 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 52 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2779  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 45 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0322855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  63.64 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  62.79 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3828  50S ribosomal protein L34P  66.67 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3614  50S ribosomal protein L34P  61.36 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 46 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  50.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0301  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 45 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  50.8  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>