48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1189 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1189  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.580221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2570  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  71.88 
 
 		 730 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.980594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  64.86 
 
 		 695 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  65.62 
 
 		 692 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  63.89 
 
 		 718 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  67.74 
 
 		 706 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  65.62 
 
 		 695 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.56 
 
 		 816 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0513  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  67.74 
 
 		 623 aa  50.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.05 
 
 		 721 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1995  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.37 
 
 		 709 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0898162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.05 
 
 		 627 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  66.67 
 
 		 813 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.94 
 
 		 719 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.9 
 
 		 730 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.06 
 
 		 800 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000021031  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1855  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000728203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.26 
 
 		 705 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3581  hypothetical protein  54.55 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4658  hypothetical protein  54.55 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0646  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.38 
 
 		 696 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132822  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  66.67 
 
 		 710 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0906  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.57 
 
 		 715 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.06 
 
 		 630 aa  43.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.06 
 
 		 697 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0335  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.67 
 
 		 639 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.84 
 
 		 704 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3016  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  60.71 
 
 		 685 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3480  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.67 
 
 		 627 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.308899  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.61 
 
 		 638 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2107  hypothetical protein  40.38 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.12 
 
 		 689 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1783  hypothetical protein  40.38 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0846066  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2681  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.61 
 
 		 681 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1819  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.61 
 
 		 636 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02295  hypothetical protein  51.52 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2719  hypothetical protein  41.18 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2341  hypothetical protein  41.18 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1780  hypothetical protein  48.39 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.219233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1699  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2743  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2686  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2903  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.314108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2384  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2808  hypothetical protein  53.33 
 
 		 899 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0628  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497536  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0378  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.57 
 
 		 606 aa  40  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0226  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.57 
 
 		 606 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00295512  normal  0.636245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>