31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1855 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1855  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000728203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  64.71 
 
 
705 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1819  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  60 
 
 
636 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  62.5 
 
 
630 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  61.76 
 
 
695 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1995  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.82 
 
 
709 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0898162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  64.52 
 
 
697 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.14 
 
 
686 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.14 
 
 
816 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.56 
 
 
627 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3016  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  64.52 
 
 
685 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2681  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.14 
 
 
681 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.14 
 
 
638 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.38 
 
 
800 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000021031  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.06 
 
 
813 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  62.07 
 
 
710 aa  47  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.18 
 
 
704 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0513  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  55.88 
 
 
623 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1189  hypothetical protein  43.75 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.580221  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0455  hypothetical protein  48.98 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  61.29 
 
 
695 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.06 
 
 
692 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50 
 
 
689 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2570  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50 
 
 
730 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.980594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.52 
 
 
718 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.67 
 
 
719 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0335  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.33 
 
 
639 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0378  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.85 
 
 
606 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73925  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0226  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.85 
 
 
606 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00295512  normal  0.636245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.06 
 
 
706 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.34 
 
 
721 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>