290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0161 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0161    100 
 
 		 261 bp  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00111253  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3331    100 
 
 		 698 bp  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3341    100 
 
 		 698 bp  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.720184  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  100 
 
 		 698 bp  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0068  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 504 bp  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518742 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0104  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 504 bp  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00262405  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0557  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 504 bp  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2655    99.55 
 
 		 698 bp  436  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2252  IS1 transposase orfB  99.55 
 
 		 504 bp  436  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.657122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0074  IS1 transposase orfB  99.11 
 
 		 504 bp  428  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2309  IS1 transposase orfB  97.77 
 
 		 504 bp  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00509  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.584705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00313  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00340  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00503    97.32 
 
 		 1860 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00571  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00587  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01242    97.32 
 
 		 2672 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01934  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01385  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02450    97.32 
 
 		 2195 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00344  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01921  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00560  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04214    97.32 
 
 		 2201 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.611997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0702    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206083  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0065  IS1, transposase orfB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4730    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0248    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.702229  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00534  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00317  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01253  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01871  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000392392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00576  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00240  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.909946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0330  IS1, transposase orfB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4520    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02416  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00025  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02102  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0798    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2996  IS1 transposase orfB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.217077 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0876    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.853635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0868    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0787    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0062101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2007  IS1 transposase orfB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1411    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.309967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2784    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00747865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1101    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3345    97.32 
 
 		 2256 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  97.32 
 
 		 698 bp  396  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3257    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1030  IS1 transposase orfB  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.871892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04179  hypothetical protein  97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4354    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4013    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3533    97.32 
 
 		 504 bp  396  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01115    96.88 
 
 		 1689 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01117  IS1 protein InsB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02040  IS1 protein InsB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02514  IS1 protein InsB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02645    96.88 
 
 		 1425 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02646  IS1 protein InsB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02823  IS1 protein InsB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000374053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03226    96.88 
 
 		 1863 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03227  IS1 protein InsB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03483    96.88 
 
 		 1673 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03484  IS1 protein InsB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04281  IS1 protein InsB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0271    96.88 
 
 		 698 bp  389  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3576    96.88 
 
 		 698 bp  389  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000806307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3685    96.88 
 
 		 698 bp  389  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.406239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3780    96.88 
 
 		 698 bp  389  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4691  hypothetical protein  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000333815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0739  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00024765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1530  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1651  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000315416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1779  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1900  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2701  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2761  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000020143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2785  IS1, transposase orfB  96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000643973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2587    96.88 
 
 		 504 bp  389  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>