13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0036 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0036  conjugal transfer protein TraK  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4286  conjugal transfer protein TraK  31.09 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4499  type-F conjugative transfer system secretin TraK  24.1 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4441  type-F conjugative transfer system secretin TraK  24.1 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4445  Type-F conjugative transfer system secretin TraK  24.01 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4538  type-F conjugative transfer system secretin TraK  24.01 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30335  normal  0.434856 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4375  type-F conjugative transfer system secretin TraK  24.01 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.879332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4630  type-F conjugative transfer system secretin TraK  23.38 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6228  hypothetical protein  28.37 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_05  conjugative transfer protein TraK  23.21 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0025  hypothetical protein  22.52 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0017  hypothetical protein  23.4 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.379631  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0931  hypothetical protein  20.57 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>