24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2781 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2781  DinI family protein  100 
 
 
64 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000163675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3116  hypothetical protein  87.5 
 
 
82 aa  114  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5549  hypothetical protein  85.94 
 
 
82 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3864  hypothetical protein  85.94 
 
 
82 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0870  hypothetical protein  85.94 
 
 
82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4489  DNA-damage-inducible protein  85.94 
 
 
82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347422  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1100  hypothetical protein  85.94 
 
 
82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2160  hypothetical protein  71.88 
 
 
68 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.146724  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2221  hypothetical protein  71.88 
 
 
68 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.006117  hitchhiker  0.00000000000000288477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2831  hypothetical protein  39.06 
 
 
77 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.656931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1127  hypothetical protein  39.06 
 
 
77 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157001  normal  0.695719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2279  hypothetical protein  39.06 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.42074  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1090  hypothetical protein  39.06 
 
 
79 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1058  hypothetical protein  39.06 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.767989  decreased coverage  0.000000199344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2256  DinI family protein  39.06 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0395407  hitchhiker  0.000256191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3109  DinI family protein  40.62 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0209906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  37.5 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  40.62 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  32.81 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  35.94 
 
 
79 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  34.85 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  34.85 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  34.85 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  34.85 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>