47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1090 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1090  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2831  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.656931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1127  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157001  normal  0.695719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1058  hypothetical protein  98.7 
 
 
77 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.767989  decreased coverage  0.000000199344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2279  hypothetical protein  98.7 
 
 
77 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.42074  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2256  DinI family protein  58.44 
 
 
77 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0395407  hitchhiker  0.000256191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  52.63 
 
 
80 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  52.56 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  52.56 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  52.56 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  52.56 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  47.44 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  48.72 
 
 
79 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1274  DNA damage-inducible protein I  51.28 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.860825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  50 
 
 
80 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  47.37 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1440  DNA damage-inducible protein I  48.72 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.398572  normal  0.0309658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01065  hypothetical protein  48.72 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2068  DNA damage-inducible protein I  48.72 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348863  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1575  DinI family protein  50 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2539  DNA damage-inducible protein I  48.72 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0403017  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2585  DinI family protein  48.72 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.534423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1184  DNA damage-inducible protein I  48.72 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1184  DNA damage-inducible protein I  48.72 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01057  DNA damage-inducible protein I  48.72 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2266  DNA damage-inducible protein I  47.44 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  46.25 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  46.25 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  46.25 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1100  hypothetical protein  43.75 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4489  DNA-damage-inducible protein  43.75 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347422  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0870  hypothetical protein  40.74 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3116  hypothetical protein  42.5 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5549  hypothetical protein  42.5 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3864  hypothetical protein  42.5 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3109  DinI family protein  39.74 
 
 
81 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0209906  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2160  hypothetical protein  43.94 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.146724  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2221  hypothetical protein  43.94 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.006117  hitchhiker  0.00000000000000288477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2782  DinI family protein  34.62 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398825  hitchhiker  0.000224366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00836  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00827  Prophage protein  33.33 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.439708  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0920  dinI family protein  33.33 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0793544  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2781  DinI family protein  39.06 
 
 
64 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000163675  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0038  protein ImpC  40.74 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511285  normal  0.0568274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3504  DinI family protein  32.89 
 
 
160 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1396  putative DNA-damage-inducible protein I (DinI)  33.33 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.598582  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_11  putative DNA-damage-inducible protein  25.64 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.819389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>