40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2221 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2221  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.006117  hitchhiker  0.00000000000000288477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2160  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.146724  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3116  hypothetical protein  85.29 
 
 
82 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4489  DNA-damage-inducible protein  83.82 
 
 
82 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347422  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1100  hypothetical protein  83.82 
 
 
82 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5549  hypothetical protein  82.35 
 
 
82 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3864  hypothetical protein  82.35 
 
 
82 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0870  hypothetical protein  83.33 
 
 
82 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2781  DinI family protein  71.88 
 
 
64 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000163675  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1127  hypothetical protein  43.94 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157001  normal  0.695719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2831  hypothetical protein  43.94 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.656931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2279  hypothetical protein  43.94 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.42074  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1058  hypothetical protein  43.94 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.767989  decreased coverage  0.000000199344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1090  hypothetical protein  43.94 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2256  DinI family protein  46.97 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0395407  hitchhiker  0.000256191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3109  DinI family protein  43.94 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0209906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1895  DNA damage-inducible protein I  36.36 
 
 
79 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324508  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  45.45 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  36.36 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  38.24 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  36.36 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  34.78 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  34.78 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  34.78 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  34.78 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01057  DNA damage-inducible protein I  37.68 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2585  DinI family protein  37.68 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.534423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01065  hypothetical protein  37.68 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  36.76 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1184  DNA damage-inducible protein I  37.68 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1184  DNA damage-inducible protein I  37.68 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  36.76 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  36.76 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2539  DNA damage-inducible protein I  37.68 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0403017  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1440  DNA damage-inducible protein I  37.68 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.398572  normal  0.0309658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2068  DNA damage-inducible protein I  37.68 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348863  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2266  DNA damage-inducible protein I  37.68 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1274  DNA damage-inducible protein I  33.33 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.860825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1575  DinI family protein  36.23 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_11  putative DNA-damage-inducible protein  34.33 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.819389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>