11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0067 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0039    97.62 
 
 		 519 bp  906    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0067    100 
 
 		 1151 bp  2282    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3139    95.65 
 
 		 671 bp  1053    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0140    98.58 
 
 		 423 bp  791    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3134    97.64 
 
 		 393 bp  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0139    97.1 
 
 		 243 bp  414  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4773  hypothetical protein  91.02 
 
 		 300 bp  303  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.518043  normal  0.771182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4774    89.72 
 
 		 234 bp  125  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.479562  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0012  IS3 family transposase  100 
 
 		 519 bp  79.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.581726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 		 1518 bp  52  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 		 1518 bp  52  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>