7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3134 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3134    100 
 
 		 393 bp  779    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0067    97.64 
 
 		 1151 bp  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0012  IS3 family transposase  96.6 
 
 		 519 bp  252  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.581726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4774    89.72 
 
 		 234 bp  125  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.479562  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09770  Transposase IS3/IS911  100 
 
 		 285 bp  56  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40540  Transposase IS3/IS911  100 
 
 		 285 bp  56  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41880  Transposase IS3/IS911  100 
 
 		 285 bp  56  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>