53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4276 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4276    100 
 
 
1203 bp  2385    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0036  transposase family  82.3 
 
 
1233 bp  65.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  83.95 
 
 
1572 bp  58  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  83.95 
 
 
1572 bp  58  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  83.95 
 
 
1572 bp  58  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  83.95 
 
 
1572 bp  58  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  83.95 
 
 
1572 bp  58  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  83.95 
 
 
1572 bp  58  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  83.95 
 
 
1575 bp  58  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4198    89.58 
 
 
4969 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4637    89.58 
 
 
1407 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0070    89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000253615  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  89.58 
 
 
1596 bp  56  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1317 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  89.58 
 
 
1539 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0058  transposase family  90.48 
 
 
138 bp  52  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0054    87.04 
 
 
1114 bp  52  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4656  Aec53  90.24 
 
 
912 bp  50.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  87.5 
 
 
1539 bp  48.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  86.54 
 
 
1602 bp  48.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  87.5 
 
 
1539 bp  48.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>