46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0054 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0054    100 
 
 		 1114 bp  2208    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0065  IS66 family element, transposase  85.54 
 
 		 1593 bp  839    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4623  IS66 family element, transposase  85.54 
 
 		 1593 bp  839    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3899  IS66 family element, transposase  85.54 
 
 		 1593 bp  839    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  85.54 
 
 		 1593 bp  839    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2397    85.45 
 
 		 1404 bp  831    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.855533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2143  IS66 family element, transposase  85.54 
 
 		 1554 bp  839    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  85.54 
 
 		 1593 bp  839    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1284  IS66 family element, transposase  85.54 
 
 		 1593 bp  839    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1277    85.16 
 
 		 1320 bp  716    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0906  IS66 family element, transposase  85.45 
 
 		 1593 bp  831    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0847  IS66 family element, transposase  85.45 
 
 		 1593 bp  831    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0255  IS66 family element, transposase  85.45 
 
 		 1593 bp  831    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0023  IS66 family element, transposase  85.35 
 
 		 1593 bp  823    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3135    88.51 
 
 		 1613 bp  1189    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  92.31 
 
 		 1614 bp  1530    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4296    89.14 
 
 		 1404 bp  1253    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  88.52 
 
 		 1614 bp  1183    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1280  hypothetical protein  91.09 
 
 		 321 bp  129  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4626  hypothetical protein  91.38 
 
 		 300 bp  75.8  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0051  hypothetical protein  85.37 
 
 		 144 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1085    87.14 
 
 		 138 bp  60  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4656  Aec53  96.67 
 
 		 912 bp  52  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4276    87.04 
 
 		 1203 bp  52  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4273  ISSfl4 ORF3  88.64 
 
 		 621 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4877    88.64 
 
 		 1385 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2933    88.64 
 
 		 1540 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  88.64 
 
 		 1539 bp  48.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>