21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1467 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1467  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  308  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2762  hypothetical protein  98.7 
 
 
154 aa  304  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.470616 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0244  hypothetical protein  45.86 
 
 
174 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5057  putative tail protein  36.81 
 
 
145 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0225452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0699  putative tail protein  37.5 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2795  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1288  hypothetical protein  30.3 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1052  hypothetical protein  34.34 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1032  hypothetical protein, putative phage gene  28.93 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0700  prophage PSPPH06, putative tail protein  22.3 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0582  hypothetical protein  27.86 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.813808 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0902  hypothetical protein  29.46 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0652608  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2857  P2 phage tail completion protein R  25.2 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0934  phage tail completion protein R  28.44 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3487  hypothetical protein  30.15 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.998e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2931  hypothetical protein  30.15 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.48983e-19 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05030  hypothetical protein  25.87 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2768  P2 phage tail completion R family protein  27.52 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0711494  decreased coverage  0.0000189882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3040  phage tail completion protein R  27.93 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000372117 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00838  putative phage tail protein  27.93 
 
 
143 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00844  hypothetical protein  27.93 
 
 
143 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>