16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1052 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1052  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1032  hypothetical protein, putative phage gene  38.26 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2931  hypothetical protein  31.51 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.48983e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3487  hypothetical protein  31.51 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.998e-18 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0726  hypothetical protein  28.48 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5057  putative tail protein  31.72 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0225452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0699  putative tail protein  32.28 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2795  hypothetical protein  25.38 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0582  hypothetical protein  34.04 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.813808 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0902  hypothetical protein  27.94 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0652608  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0938  phage-like protein  25.74 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05030  hypothetical protein  33.64 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1467  hypothetical protein  34.34 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2762  hypothetical protein  34.34 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.470616 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0244  hypothetical protein  29.7 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1288  hypothetical protein  27.68 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>