16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3487 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2931  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.48983e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3487  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.998e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2795  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0902  hypothetical protein  41.72 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0652608  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0938  phage-like protein  35.71 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1032  hypothetical protein, putative phage gene  31.45 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1052  hypothetical protein  31.51 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05030  hypothetical protein  29.81 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0582  hypothetical protein  28.87 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.813808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1467  hypothetical protein  30.88 
 
 
154 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2762  hypothetical protein  30.88 
 
 
154 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.470616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1288  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0726  hypothetical protein  32.61 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0699  putative tail protein  29.03 
 
 
145 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5057  putative tail protein  28.85 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0225452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0244  hypothetical protein  30.33 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>