17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2404 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2404  protein of unknown function DUF1105  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0238  hypothetical protein  40.33 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1277  hypothetical protein  23.76 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.271248  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1919  hypothetical protein  27.67 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.795239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4379  putative peptidoglycan peptidase  27.03 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.472041 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4078  putative peptidoglycan peptidase  27.03 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03772  hypothetical protein  27.03 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.608864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3594  hypothetical protein  28.74 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.528235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03823  predicted peptidoglycan peptidase  27.03 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4475  putative peptidoglycan peptidase  27.03 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.482893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4170  putative peptidoglycan peptidase  27.03 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5397  putative peptidoglycan peptidase  27.03 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.75076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3735  hypothetical protein  21.2 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145153  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4048  protein of unknown function DUF1105  26.35 
 
 		 202 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4423  putative peptidoglycan peptidase  27.03 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.770264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7166  putative peptidoglycan peptidase  29.58 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0208  hypothetical protein  34.62 
 
 		 326 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>