33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7166 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7166  putative peptidoglycan peptidase  100 
 
 		 210 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3515  putative peptidoglycan peptidase  58.52 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3647  putative peptidoglycan peptidase  46.33 
 
 		 218 aa  194  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4048  protein of unknown function DUF1105  49.14 
 
 		 202 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5397  putative peptidoglycan peptidase  49.14 
 
 		 202 aa  184  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.75076 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4078  putative peptidoglycan peptidase  49.14 
 
 		 202 aa  184  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03772  hypothetical protein  49.14 
 
 		 202 aa  184  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.608864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4379  putative peptidoglycan peptidase  48.57 
 
 		 202 aa  184  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.472041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4475  putative peptidoglycan peptidase  49.14 
 
 		 202 aa  184  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.482893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4170  putative peptidoglycan peptidase  49.14 
 
 		 202 aa  184  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03823  predicted peptidoglycan peptidase  49.14 
 
 		 202 aa  184  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4423  putative peptidoglycan peptidase  49.14 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.770264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3368  putative peptidoglycan peptidase  46.63 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1770  hypothetical protein  24.85 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1324  hypothetical protein  24.85 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2092  hypothetical protein  24.71 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000442372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1778  protein of unknown function DUF1105  24.26 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01833  hypothetical protein  24.85 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.64408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01821  hypothetical protein  24.85 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.500507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2598  hypothetical protein  24.85 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1955  hypothetical protein  24.85 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2056  hypothetical protein  25.73 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0690594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2051  hypothetical protein  25.73 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1226  hypothetical protein  25.73 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1351  hypothetical protein  26.23 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2111  hypothetical protein  25.73 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0232876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2264  protein of unknown function DUF1105  23.78 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5138  hypothetical protein  21.86 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1902  hypothetical protein  22.22 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0157  protein of unknown function DUF1105  25.53 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4808  hypothetical protein  21.91 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0290203  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3359  hypothetical protein  21.91 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2404  protein of unknown function DUF1105  29.58 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>