32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4423 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03823  predicted peptidoglycan peptidase  99.5 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03772  hypothetical protein  99.5 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.608864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4423  putative peptidoglycan peptidase  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.770264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4078  putative peptidoglycan peptidase  99.5 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4475  putative peptidoglycan peptidase  99.5 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.482893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4170  putative peptidoglycan peptidase  99.5 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5397  putative peptidoglycan peptidase  98.51 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.75076 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4048  protein of unknown function DUF1105  98.02 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4379  putative peptidoglycan peptidase  96.81 
 
 		 202 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.472041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3368  putative peptidoglycan peptidase  50.53 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7166  putative peptidoglycan peptidase  49.14 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3515  putative peptidoglycan peptidase  43 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3647  putative peptidoglycan peptidase  47.73 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1351  hypothetical protein  31.32 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2056  hypothetical protein  31.15 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0690594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2051  hypothetical protein  31.15 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1226  hypothetical protein  31.46 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2092  hypothetical protein  29.44 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000442372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1778  protein of unknown function DUF1105  29.44 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1770  hypothetical protein  29.44 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1324  hypothetical protein  29.44 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2111  hypothetical protein  30.6 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0232876 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1955  hypothetical protein  29.44 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01833  hypothetical protein  29.44 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.64408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01821  hypothetical protein  29.44 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.500507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2598  hypothetical protein  28.89 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1902  hypothetical protein  28.49 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5138  hypothetical protein  27.53 
 
 		 241 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2897  hypothetical protein  26.4 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4808  hypothetical protein  26.06 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0290203  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3359  hypothetical protein  26.06 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0157  protein of unknown function DUF1105  30.08 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>