15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3735 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3735  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  420  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5635  hypothetical protein  66.5 
 
 
211 aa  273  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4678  hypothetical protein  68.16 
 
 
215 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1277  hypothetical protein  66.02 
 
 
211 aa  262  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.271248  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2299  hypothetical protein  60.93 
 
 
223 aa  256  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1558  hypothetical protein  60.43 
 
 
245 aa  254  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46145  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2089  hypothetical protein  55.51 
 
 
230 aa  252  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4614  hypothetical protein  53.33 
 
 
225 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3376  hypothetical protein  54.91 
 
 
241 aa  238  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11141  hypothetical protein  53.78 
 
 
286 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4093  hypothetical protein  52.47 
 
 
224 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4169  hypothetical protein  52.47 
 
 
224 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194045  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4323  hypothetical protein  52.47 
 
 
224 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424016  normal  0.117696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1503  hypothetical protein  70.49 
 
 
98 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2404  protein of unknown function DUF1105  21.2 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>