11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1468 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1468  anti-ECFsigma factor, ChrR  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.732817  normal  0.0198654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1433  hypothetical protein  51.66 
 
 		 232 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0081  hypothetical protein  51.66 
 
 		 232 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.22706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3313  hypothetical protein  49.77 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.425102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0899  hypothetical protein  33.8 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.260517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2588  hypothetical protein  32.05 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2127  hypothetical protein  32 
 
 		 206 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4914  putative transcriptional regulator protein  31.76 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.653617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5777  putative transcriptional regulator protein  27.91 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5541  putative transcriptional regulator protein  26.36 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.871085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4826  putative transcriptional regulator protein  28.14 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>