11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4914 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4914  putative transcriptional regulator protein  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.653617  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4826  putative transcriptional regulator protein  81.5 
 
 
201 aa  337  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2127  hypothetical protein  49.75 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45535  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5777  putative transcriptional regulator protein  42.86 
 
 
196 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5541  putative transcriptional regulator protein  42.5 
 
 
196 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.871085  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4829  hypothetical protein  34.36 
 
 
231 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4917  hypothetical protein  38.26 
 
 
232 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6307  hypothetical protein  37.72 
 
 
235 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4594  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1468  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.76 
 
 
231 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.732817  normal  0.0198654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0899  hypothetical protein  25.17 
 
 
224 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.260517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>