13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5777 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5777  putative transcriptional regulator protein  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5541  putative transcriptional regulator protein  95.92 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.871085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4914  putative transcriptional regulator protein  42.86 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.653617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4826  putative transcriptional regulator protein  42.71 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2127  hypothetical protein  38.78 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4917  hypothetical protein  31.63 
 
 		 232 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4829  hypothetical protein  30.21 
 
 		 231 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6307  hypothetical protein  26 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4594  hypothetical protein  28.48 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3313  hypothetical protein  27.93 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.425102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1468  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.91 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.732817  normal  0.0198654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1433  hypothetical protein  34.67 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0081  hypothetical protein  34.67 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.22706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>