11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4826 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4826  putative transcriptional regulator protein  100 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4914  putative transcriptional regulator protein  81.5 
 
 		 201 aa  337  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.653617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2127  hypothetical protein  48.29 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5777  putative transcriptional regulator protein  42.71 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5541  putative transcriptional regulator protein  42.5 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.871085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4829  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4917  hypothetical protein  39.13 
 
 		 232 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6307  hypothetical protein  35.4 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4594  hypothetical protein  34.38 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2588  hypothetical protein  26.47 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1468  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.14 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.732817  normal  0.0198654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>