30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2086 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2086  germination protease  100 
 
 
328 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1166  germination protease  61.28 
 
 
326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.901196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3831  germination protease  56.44 
 
 
328 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000490039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0124  germination protease  57.28 
 
 
316 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0631  germination protease  54.92 
 
 
314 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1038  germination protease  46.71 
 
 
341 aa  318  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000076763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1790  germination protease  47.71 
 
 
327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2088  germination protease  47.68 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000121872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12860  germination protease  45.81 
 
 
337 aa  299  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000873283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2013  germination protease  45.99 
 
 
325 aa  291  8e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2298  germination protease  45.99 
 
 
325 aa  291  9e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1978  germination protease  45.18 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000089254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1177  germination protease  42.49 
 
 
358 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0671505  hitchhiker  0.000569183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0926  germination protease  47.47 
 
 
325 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00655753  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0761  germination protease  43.79 
 
 
317 aa  272  7e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.802338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4454  germination protease  40.67 
 
 
367 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4058  germination protease  40.39 
 
 
367 aa  265  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.290934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3048  germination protease  41.34 
 
 
367 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0487193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4172  germination protease  40.39 
 
 
367 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4402  germination protease  40.95 
 
 
367 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4440  germination protease  40.44 
 
 
367 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0796  germination protease  40.44 
 
 
367 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0164224  hitchhiker  3.78983e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1006  germination protease  41.58 
 
 
372 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2004  germination protease  48.14 
 
 
343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.996739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2444  germination protease  40.38 
 
 
372 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000364283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4343  germination protease  39.72 
 
 
368 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92721e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4546  germination protease  39.72 
 
 
368 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4068  germination protease  39.72 
 
 
368 aa  255  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0281796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4220  germination protease  39.72 
 
 
368 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0681612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2317  germination protease  36.83 
 
 
307 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>