30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1038 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1038  germination protease  100 
 
 		 341 aa  680    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000076763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1978  germination protease  69.7 
 
 		 335 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000089254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2088  germination protease  56.44 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000121872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2298  germination protease  53.82 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2013  germination protease  53.82 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1790  germination protease  54.43 
 
 		 327 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1166  germination protease  48 
 
 		 326 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.901196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2086  germination protease  46.71 
 
 		 328 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4454  germination protease  46.39 
 
 		 367 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0796  germination protease  46.11 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0164224  hitchhiker  3.78983e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4172  germination protease  45.83 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4402  germination protease  45.83 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4058  germination protease  46.11 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.290934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3831  germination protease  46.01 
 
 		 328 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000490039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4440  germination protease  46.11 
 
 		 367 aa  311  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3048  germination protease  46.24 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0487193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2444  germination protease  44.63 
 
 		 372 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000364283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4546  germination protease  46.11 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4343  germination protease  46.11 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92721e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4068  germination protease  46.11 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0281796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4220  germination protease  46.11 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0681612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1177  germination protease  43.02 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0671505  hitchhiker  0.000569183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1006  germination protease  43.56 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12860  germination protease  43.2 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000873283  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2004  germination protease  48.92 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.996739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0631  germination protease  45.09 
 
 		 314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0124  germination protease  45.34 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0926  germination protease  44.27 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00655753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0761  germination protease  38.63 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.802338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2317  germination protease  42.01 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>