30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2298 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2298  germination protease  100 
 
 
325 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2013  germination protease  99.08 
 
 
325 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1038  germination protease  53.82 
 
 
341 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000076763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2088  germination protease  55.69 
 
 
321 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000121872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1978  germination protease  50.45 
 
 
335 aa  331  8e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000089254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1790  germination protease  48.01 
 
 
327 aa  319  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3831  germination protease  47.22 
 
 
328 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000490039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12860  germination protease  45.9 
 
 
337 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000873283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2086  germination protease  45.99 
 
 
328 aa  291  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0631  germination protease  44.31 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2004  germination protease  47.48 
 
 
343 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.996739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1177  germination protease  39.88 
 
 
358 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0671505  hitchhiker  0.000569183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3048  germination protease  42.65 
 
 
367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0487193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4172  germination protease  41.21 
 
 
367 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4454  germination protease  41.5 
 
 
367 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0796  germination protease  41.21 
 
 
367 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0164224  hitchhiker  3.78983e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4402  germination protease  41.5 
 
 
367 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4058  germination protease  41.21 
 
 
367 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.290934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1166  germination protease  42.33 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.901196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2444  germination protease  41.08 
 
 
372 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000364283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4440  germination protease  40.63 
 
 
367 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0124  germination protease  45.14 
 
 
316 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0761  germination protease  42.37 
 
 
317 aa  257  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.802338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4220  germination protease  40.8 
 
 
368 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0681612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4343  germination protease  40.8 
 
 
368 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92721e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4546  germination protease  40.8 
 
 
368 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4068  germination protease  40.8 
 
 
368 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0281796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1006  germination protease  38.53 
 
 
372 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0926  germination protease  41.07 
 
 
325 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00655753  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2317  germination protease  42.31 
 
 
307 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>