39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1786 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1786  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0800  hypothetical protein  65.48 
 
 
198 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1911  hypothetical protein  54.82 
 
 
197 aa  208  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2859  hypothetical protein  50.75 
 
 
212 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  30 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1604  hypothetical protein  26.04 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00253793  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2501  GPR1/FUN34/YaaH family protein  27.27 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.07917e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3245  GPR1/FUN34/YaaH family protein  26.06 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.63 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3336  hypothetical protein  26.06 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000909805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1667  hypothetical protein  26.06 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  hitchhiker  6.45658e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3650  hypothetical protein  26.06 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3560  hypothetical protein  26.06 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.06 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3251  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.06 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000382822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3597  hypothetical protein  26.06 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3556  hypothetical protein  26.06 
 
 
206 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000310297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3551  hypothetical protein  26.06 
 
 
206 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8351e-43 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.19 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  26.04 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.11 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  28.43 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.66 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  26.15 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  26.15 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0383  GPR1/FUN34/YaaH family protein  27.13 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  27.03 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  26.15 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  27.32 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  27.03 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  27.03 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  27.03 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.14 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  27.03 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.17 
 
 
255 aa  41.6  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.88 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  27.6 
 
 
197 aa  41.6  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.34 
 
 
196 aa  41.2  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.546055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>