25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1911 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1911  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2859  hypothetical protein  59.6 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0800  hypothetical protein  58.08 
 
 
198 aa  214  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1786  hypothetical protein  54.82 
 
 
205 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2501  GPR1/FUN34/YaaH family protein  32.81 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.07917e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.29 
 
 
199 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.41 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  28.93 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  28.19 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1604  hypothetical protein  26.04 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00253793  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.19 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3336  hypothetical protein  28.19 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000909805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3560  hypothetical protein  28.19 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3650  hypothetical protein  28.19 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1667  hypothetical protein  28.19 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  hitchhiker  6.45658e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3597  hypothetical protein  28.19 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  27.13 
 
 
211 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  30.65 
 
 
197 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3245  GPR1/FUN34/YaaH family protein  27.66 
 
 
206 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.46 
 
 
201 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.22 
 
 
196 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  27.69 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  27.69 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  27.69 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>