15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1384 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1384  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  697    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1391  hypothetical protein  70.51 
 
 
264 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.893192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1392  hypothetical protein  58.14 
 
 
417 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1390  hypothetical protein  62.34 
 
 
254 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0923  hypothetical protein  38.81 
 
 
257 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2401  hypothetical protein  31.03 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000130925  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5412  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5519  hypothetical protein  32.92 
 
 
231 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.08164  normal  0.267053 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0009  hypothetical protein  33.19 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2680  hypothetical protein  32.92 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2683  hypothetical protein  31.97 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.906149  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0924  hypothetical protein  25.3 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  44.74 
 
 
619 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2917  hypothetical protein  22.62 
 
 
205 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  38.46 
 
 
1202 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>