15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1392 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1392  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  835    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1390  hypothetical protein  61.6 
 
 
254 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1391  hypothetical protein  61.79 
 
 
264 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.893192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1384  hypothetical protein  58.14 
 
 
341 aa  289  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0923  hypothetical protein  42.11 
 
 
257 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0009  hypothetical protein  32.74 
 
 
230 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2401  hypothetical protein  31.84 
 
 
239 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000130925  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5519  hypothetical protein  33.02 
 
 
231 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.08164  normal  0.267053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2683  hypothetical protein  33.02 
 
 
233 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.906149  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5412  hypothetical protein  32.09 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2680  hypothetical protein  32.56 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0924  hypothetical protein  29.87 
 
 
237 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1015  hypothetical protein  27.37 
 
 
245 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2917  hypothetical protein  28.21 
 
 
205 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1184  hypothetical protein  23.46 
 
 
259 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000446207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>