23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2949 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2949  TOPRIM domain protein  100 
 
 
115 aa  235  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0350  TOPRIM domain protein  53.57 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3082  TOPRIM domain protein  52.88 
 
 
119 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3585  TOPRIM domain-containing protein  51.46 
 
 
114 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000963608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4812  TOPRIM domain-containing protein  50.49 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000913447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5128  TOPRIM domain-containing protein  50.49 
 
 
114 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4699  DNA primase  50.49 
 
 
114 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5096  Toprim domain protein  50.49 
 
 
114 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4715  DNA primase  50.49 
 
 
114 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000708612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5132  Toprim domain protein  50.49 
 
 
114 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000167755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0107  Toprim domain protein  50.49 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000016673  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5133  Toprim domain protein  50.49 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5226  TOPRIM domain-containing protein  49.51 
 
 
114 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4858  TOPRIM domain-containing protein  49.51 
 
 
114 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0487  TOPRIM domain-containing protein  47.62 
 
 
128 aa  104  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0852  TOPRIM domain-containing protein  42.59 
 
 
128 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000918877  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0836  TOPRIM domain-containing protein  42.59 
 
 
129 aa  97.4  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00405243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2931  TOPRIM domain protein  50.49 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000218405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  32.5 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  31.96 
 
 
205 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0130  primase/topoisomerase like protein  29.49 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  32.93 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  29.73 
 
 
180 aa  40.4  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>