41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2931 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2931  TOPRIM domain protein  100 
 
 		 116 aa  233  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000218405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3082  TOPRIM domain protein  71.3 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3585  TOPRIM domain-containing protein  66.37 
 
 		 114 aa  163  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000963608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0107  Toprim domain protein  66.37 
 
 		 114 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000016673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5133  Toprim domain protein  66.37 
 
 		 114 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4812  TOPRIM domain-containing protein  66.37 
 
 		 114 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000913447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5128  TOPRIM domain-containing protein  65.49 
 
 		 114 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5096  Toprim domain protein  66.37 
 
 		 114 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4699  DNA primase  66.37 
 
 		 114 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5132  Toprim domain protein  66.37 
 
 		 114 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000167755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4715  DNA primase  66.37 
 
 		 114 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000708612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4858  TOPRIM domain-containing protein  66.37 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5226  TOPRIM domain-containing protein  66.37 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647846  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0487  TOPRIM domain-containing protein  50 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0836  TOPRIM domain-containing protein  46.23 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00405243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0852  TOPRIM domain-containing protein  46.23 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000918877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2949  TOPRIM domain protein  50.49 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0350  TOPRIM domain protein  47.22 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  31.71 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0207  ribonuclease M5  32.11 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000177928  normal  0.0149756 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1510  primase/topoisomerase like protein  35.37 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457105  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  42.42 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  29.76 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  36.23 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0212  ribonuclease M5  32.94 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2527  primase-like protein  36.59 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  25.61 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2841  primase-like protein  36.59 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0526  hypothetical protein  30.95 
 
 		 178 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0178284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0513  hypothetical protein  30.95 
 
 		 178 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.029642  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl004  nucleotidyltransferase, primase  38.71 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0049  primase-related protein  29.76 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0036  ribonuclease M5  29.76 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000747887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0036  ribonuclease M5  29.76 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0045  primase-related protein  29.76 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0039  primase-related protein  29.76 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0038  primase-related protein  29.76 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0038  primase-related protein  29.76 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  30.95 
 
 		 187 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1781  primase-related protein  30.95 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26186  predicted protein  33.78 
 
 		 215 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.347334  normal  0.492829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>