More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0651 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0651  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 
289 aa  548  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0717211  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.29 
 
 
280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.29 
 
 
280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.82 
 
 
280 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.82 
 
 
280 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.82 
 
 
280 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2703  phosphate ABC transporter permease  47.97 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2973  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  49.43 
 
 
293 aa  248  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.08 
 
 
281 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0652  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.42 
 
 
290 aa  232  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.180662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2520  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  51.66 
 
 
276 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.96 
 
 
297 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.68 
 
 
297 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.76 
 
 
300 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.84 
 
 
294 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.59 
 
 
297 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.59 
 
 
297 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.59 
 
 
297 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.59 
 
 
297 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.59 
 
 
297 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.59 
 
 
297 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.15 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.15 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.15 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.15 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.12 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.15 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.79 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.22 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.38 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  50.64 
 
 
300 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.67 
 
 
294 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.17 
 
 
293 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.31 
 
 
293 aa  208  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.07 
 
 
288 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.16 
 
 
294 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.07 
 
 
296 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  45.53 
 
 
291 aa  205  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.34 
 
 
296 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.34 
 
 
296 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.34 
 
 
296 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  41.07 
 
 
296 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.07 
 
 
296 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.07 
 
 
296 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.24 
 
 
301 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.34 
 
 
296 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  41.07 
 
 
296 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.07 
 
 
296 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.07 
 
 
296 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.07 
 
 
296 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.24 
 
 
301 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.07 
 
 
296 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.3 
 
 
296 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.28 
 
 
296 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  48.03 
 
 
294 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.73 
 
 
279 aa  201  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.239867  normal  0.961378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.62 
 
 
290 aa  201  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0199  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.36 
 
 
277 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.998664  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.61 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1716  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.25 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4001  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.5 
 
 
296 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1334  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.26 
 
 
285 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812024  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4233  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.27 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4195  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.27 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.0222213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1531  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.97 
 
 
294 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4169  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.27 
 
 
295 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0743  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.07 
 
 
277 aa  199  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.82 
 
 
286 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2024  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.46 
 
 
294 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.433371  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.79 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4586  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.97 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4265  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.03 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4921  phosphate ABC transporter permease  44.49 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1438  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  43.59 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4210  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.65 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.59 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0383637  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.77 
 
 
288 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  44.17 
 
 
354 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1348  ABC transporter phosphate permease  44.75 
 
 
287 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.607986  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1284  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.75 
 
 
287 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  41.61 
 
 
291 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  42.14 
 
 
297 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1309  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.84 
 
 
287 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0508  phosphate transport system permease protein 2  43.61 
 
 
281 aa  192  8e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.782199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4150  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.53 
 
 
340 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3410  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.29 
 
 
279 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00541  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  44.05 
 
 
289 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.175645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  43.22 
 
 
281 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0778  phosphate ABC transporter permease  44.36 
 
 
281 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0482  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  43.53 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2831  phosphate ABC transporter permease protein  41.51 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0389706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1886  phosphate ABC transporter permease  39.53 
 
 
281 aa  187  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.97 
 
 
295 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271806  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.96 
 
 
299 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0637  phosphate ABC transporter permease  42.86 
 
 
281 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5254  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.48 
 
 
297 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.96 
 
 
284 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1795  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.74 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0203685  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2221  phosphate ABC transporter permease  43.26 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.155385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3267  phosphate ABC transporter, permease protein  44.74 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>