35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4851 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4851  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 88 aa  177  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.110114  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  62.22 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  62.22 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  37.14 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  48.33 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  41.1 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  35.37 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  33.85 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  36.36 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  40.28 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  34.83 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  38.89 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  47.73 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  32.89 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  39.62 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  44.9 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  36.49 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  48.84 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  42.86 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  37.04 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  30.49 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  42.11 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  32.53 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  34.57 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  30.67 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 128 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  34.62 
 
 		 128 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  35.62 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  26.32 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  35 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  36.11 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  45.24 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  31.71 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>