13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1124 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1124  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  564  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1096  hypothetical protein  87.54 
 
 
302 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1315  hypothetical protein  84.67 
 
 
302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  46.67 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  40.38 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0814  hypothetical protein  23.96 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  27.42 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  35.21 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  23.67 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.29 
 
 
293 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  26.01 
 
 
286 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>