24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0403 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0403  Methyltransferase type 12  100 
 
 
252 aa  524  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2042  hypothetical protein  37.11 
 
 
256 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.604813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.72 
 
 
259 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
253 aa  48.9  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.48 
 
 
7541 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0264  hypothetical protein  22.95 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0278  hypothetical protein  22.95 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  25.15 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0324  hypothetical protein  25.66 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  24.52 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.6 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  24.68 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0309  hypothetical protein  23.21 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  26.13 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4628  MCP methyltransferase, CheR-type  29.25 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  24.69 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0258  methyltransferase type 12  24.78 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.27 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0304  hypothetical protein  24.78 
 
 
258 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
306 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  28 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.07 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0660  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
234 aa  42  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>