28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2038 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2038  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0286  hypothetical protein  47.78 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.448909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1261  hypothetical protein  43.61 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0911  hypothetical protein  31.23 
 
 		 390 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  23.03 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.3 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4334  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.23 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0199  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.47 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000517343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  22.4 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  26.72 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4489  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.37 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4470  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.26 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1716  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.33 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0698  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.1 
 
 		 355 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000883424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0014  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.02 
 
 		 418 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968773 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  20.97 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.67 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0157  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.07 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194598  hitchhiker  0.00636853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0595  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.92 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.880292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.43 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1706  SurA domain-containing protein  35.44 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  25.43 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  21.99 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1123  hypothetical protein  31.15 
 
 		 613 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000290136  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0756  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.15 
 
 		 696 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.97 
 
 		 442 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>