21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0286 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0286  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  828    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.448909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2038  hypothetical protein  47.68 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1261  hypothetical protein  46.43 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0911  hypothetical protein  34.26 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  23.16 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  27.39 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4334  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.38 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4489  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.21 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1706  SurA domain-containing protein  30.23 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.89 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.89 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4470  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.78 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  24.18 
 
 		 329 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.54 
 
 		 343 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0157  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.71 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194598  hitchhiker  0.00636853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0912  SurA domain protein  23.49 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.557148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2372  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 639 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000220409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  21.3 
 
 		 311 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  22.56 
 
 		 316 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.62 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.49 
 
 		 444 aa  43.1  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>