23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1706 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1706  SurA domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0286  hypothetical protein  29.08 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.448909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1261  hypothetical protein  33.05 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.22 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00064667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  31.39 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  30 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0157  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.17 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194598  hitchhiker  0.00636853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.69 
 
 		 440 aa  49.3  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.3 
 
 		 316 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4334  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.32 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2038  hypothetical protein  35.8 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4470  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 		 317 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0568  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 		 353 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000504659  normal  0.286887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4489  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  25.66 
 
 		 320 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  21.05 
 
 		 430 aa  45.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0912  SurA domain protein  25 
 
 		 311 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.557148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.56 
 
 		 433 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.6 
 
 		 432 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.43 
 
 		 343 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1508  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  19.51 
 
 		 619 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000293924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2806  peptidylprolyl isomerase  25.5 
 
 		 342 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  24.06 
 
 		 305 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>