44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1245 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1245  malonate decarboxylase acyl carrier protein  100 
 
 		 99 aa  203  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3777  malonate decarboxylase delta subunit  71.72 
 
 		 99 aa  150  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0104183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2610  malonate decarboxylase acyl carrier protein  71.72 
 
 		 99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.31883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02570  malonate decarboxylase subunit delta  50 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00238435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5085  malonate decarboxylase, delta subunit  48.98 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0444  malonate decarboxylase subunit delta  48.98 
 
 		 99 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2440  malonate decarboxylase subunit delta  50 
 
 		 99 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0411324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2881  malonate decarboxylase subunit delta  50 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0294  malonate decarboxylase subunit delta  51.02 
 
 		 99 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329066  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5300  malonate decarboxylase subunit delta  48.98 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185223  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10300  malonate decarboxylase subunit delta  46.94 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00121331  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3865  malonate decarboxylase acyl carrier protein  45.36 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4941  malonate decarboxylase acyl carrier protein  45.36 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0738205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0948  malonate decarboxylase subunit delta  41.58 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.798455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5085  malonate decarboxylase subunit delta  39.8 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.241533  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4819  malonate decarboxylase subunit delta  43.3 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030528  normal  0.0215828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1846  malonate decarboxylase subunit delta  41.24 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.431164  normal  0.0404894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4591  malonate decarboxylase subunit delta  39.36 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  33.67 
 
 		 380 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4927  malonate decarboxylase subunit delta  40.21 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461711  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0078  malonate decarboxylase acyl carrier protein  31.68 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.343361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1844  malonate decarboxylase delta subunit  34.41 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.457888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1767  malonate decarboxylase acyl carrier protein  34.18 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0891324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5373  malonate decarboxylase acyl carrier protein  32.91 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00827947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1323  malonate decarboxylase delta subunit  36.14 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4019  malonate decarboxylase delta subunit  34.62 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2894  delta subunit of malonate decarboxylase  32.26 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.222092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1058  malonate decarboxylase delta subunit  31.91 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.453426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0793  delta subunit of malonate decarboxylase  32 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0483637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0789  malonate decarboxylase subunit delta  32.04 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.058655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4413  malonate decarboxylase subunit delta  34.38 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.523505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1145  putative malonate decarboxylase delta subunit  33.77 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.719808  normal  0.745191 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1242  malonate decarboxylase subunit delta  34.38 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549114  normal  0.0355903 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1270  malonate decarboxylase subunit delta  34.38 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00245775  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1160  malonate decarboxylase subunit delta  34.38 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.965785  normal  0.221003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2049  malonate decarboxylase subunit delta  34.38 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1148  malonate decarboxylase subunit delta  34.38 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0025  malonate decarboxylase subunit delta  34.38 
 
 		 102 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0026  malonate decarboxylase subunit delta  34.38 
 
 		 102 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6856  malonate decarboxylase subunit delta  34.38 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3152  malonate decarboxylase subunit delta  35.96 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1080  malonate decarboxylase subunit delta  31.65 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4287  malonate decarboxylase subunit delta  34.74 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3297  malonate decarboxylase delta subunit  33.33 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>